Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20809Q62458 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20809Q62458 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms