Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms