Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3gl2Q62420 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms