Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrhQ62361 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrhQ62361 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms