Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms