Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms