Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cd180Q62192 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cd180Q62192 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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