Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms