Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprrQ62132 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms