Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms