Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApcQ61315 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms