Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms