Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cln3Q61124 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms