Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp17laQ61068 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp17laQ61068 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp17laQ61068 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms