Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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JrkQ60976 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
JrkQ60976 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
JrkQ60976 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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