Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms