Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms