Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms