Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms