Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms