Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms