Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms