Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms