Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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