Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms