Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynrgQ5SV85 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynrgQ5SV85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms