Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms