Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11487Q5RIS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11487Q5RIS0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms