Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim58Q5NCC9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms