Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf608Q56A10 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms