Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig2Q52KR2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms