Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnl1Q52KE7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms