Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3aQ4TU90 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms