Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem171Q4KL18 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem171Q4KL18 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem171Q4KL18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem171Q4KL18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmem171Q4KL18 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem171Q4KL18 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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