Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2Q3V1H1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms