Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms