Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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