Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ankrd53Q3V0J4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms