Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Usp48Q3V0C5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms