Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim80Q3V061 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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