Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc9Q3V038 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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