Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms