Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms