Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim15Q3UTD9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms