Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms