Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms