Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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