Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms