Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms