Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms